José Fernandes começou a actividade futebolística no SL Benfica, onde cumpriu todos os escalões jovens e uma época na então denominada equipa de Reservas, tendo apontado inúmeros golos com a camisola encarnada. No entanto, a carreira de José Fernandes prosseguiu depois por outros clubes, nomeadamente, Tirsense, Seixal, Lanheses, Beneditense, Freamunde, Sampedrense, Trofense e Louletano, antes de assinar pelo Sporting da Covilhã a meio da temporada 1995/1996, proveniente daquele emblema algarvio. Na formação serrana, o ponta de lança José Fernandes não foi muito utilizado, mas revelou sempre empenho quando foi chamado a jogo, ajudando o nosso clube a garantir pela primeira vez a subida ao formato moderno da 2ª Divisão de Honra, depois de uma acesa disputa com a Naval, que ficou somente a um ponto do conjunto covilhanense. José Fernandes rumou posteriormente a terras alentejanas, representando Lusitano de Évora e Atlético de Reguengos, mas deixando certamente várias recordações entre os adeptos serranos…